Cercozoa

Cercozoa
Rendszertani besorolás
Domén: Eukarióták (Eukaryota)
Csoport: Diaphoretickes
Csoport: Tsar
Csoport: Sar
Ország: Rhizaria
Törzs: Cercozoa
Cavalier-Smith 1998
Szinonimák
  • Rhizopoda Dujardin, 1835 stat. nov. Haeckel, 1866 emend. Cavalier-Smith, 1996
  • Filosa Cavalier-Smith et Chao, 2003
Hivatkozások
A Wikifajok tartalmaz Cercozoa témájú rendszertani információt.
A Wikimédia Commons tartalmaz Cercozoa témájú kategóriát.

A Cercozoa (más néven Filosa) egysejtű eukarióták diverz törzse. Mikroszkopikus szinten nincs közös morfológiai jellemzőjük, filogenetikájuk rRNS-, aktin- vagy poliubikvitin-alapú. Ez volt az első főleg molekuláris filogenetika alapján felfedezett fő eukariótacsoport. Számos baktériumfaj predátorai. Az összetett héjú amőboidokkal rendelkező Retaria közeli rokonai, velük együtt alkotják a Rhizariát.

Jellemzők

A legtöbb fonalas állábakkal táplálkozó amőboid és ostoros ide tartozik. Ezek korlátozódhatnak a sejtfelszín részére, de számos protozoonnal szemben nincs valódi sejtszáj. Számos formájuk lehet, és nehezen meghatározhatók szerkezeti alapon, de filogenetikai alapon együvé tartoznak.

Diverzitás

Sejtvázuk mozgáskori viselkedése alapján vannak fonalas és hálós tagok:

További ökológiai csoportok:

Ökológia

Erősen diverz morfológiájuk és fiziológiájuk mellett a Cercozoa ökológiai diverzitása is jelentős. A talaj, a tengerek és az édesvíz leggyakoribb és ökológiailag legjelentősebb protozoonjait tartalmazzák.

Talajlakó tagjai a mérsékelt égövi talajokban élő szabadon élő eukarióta mikroorganizmusok domináns csoportja: a protozoon-DNS 30%-át adják száraz és félszáraz, 15%-át nedvesebb talajokban. A protozoon-RNS 40–60%-át adják erdei és füves pusztai talajokban transzkriptomikai elemzések szerint. Az óceánfenéken a működő taxonómiai egységek 9–24%-át adják.

Egyes tagjai koprofilek vagy koprozoonok – az ürüléket tápanyagforrásként vagy állati gazdák közti közvetítésre használják. Ez a mikrobiális eukarióta diverzitás kevéssé tanulmányozott helye, ahol a Cercozoa dominál. Erősen koprofil például a Cercomonas, a Proleptomonas, a Helkesimastix és a szorokárp Guttulinopsis. Számos új ágát, különösen a Sarcomonada közt, ürülék filogenetikai elemzésével találták meg, mivel elsősorban itt található.

Bakterivor tagjai erősen diverzek és fontosak a növényi filloszféra, a levélfelszínek számára. Különösen a cisztaképzésre, táplálkozásra és néhány óra alatti osztódásra képes Sarcomonada jól alkalmazkodott a filloszféra változó környezeti tényezőihez. Táplálkozásuk befolyásolja a baktériumközösségeket: a neki kevésbé ellenálló Alphaproteobacteria és Betaproteobacteria populációit csökkenti, kedvezve más baktériumoknak, amilyen a Gammaproteobacteria.

Evolúció

Külső filogenetika

Parafiletikus Cercozoa
Rhizaria
Filosa

Reticulofilosa

Monadofilosa



Retaria

Endomyxa


Ectoreta

Taxopodida

Foraminifera

Radiolaria







Monofiletikus Cercozoa
Rhizaria
Cercozoa
Filosa

Reticulofilosa

Monadofilosa

Endomyxa

Lapot gusevi




Retaria


Foraminifera

Polycystinea

Acantharea





Eredetileg a Filosa és az Endomyxa is része volt riboszomális RNS- és tubulinalapú elemzések alapján. Ezek megerősítették, hogy a Retaria testvércsoportja a Rhizarián belül.

Azonban a csoport monofíliája kérdéses maradt. Több génes elemzések alapján parafiletikus volt a csoport, mivel az Endomyxa a Retariához volt közel, nem a Filosához. Ezért az Endomyxa kikerült a Cercozoából, így az a Filosa szinonimája lett.

Újabb, jobb mintavétellel történt filogenetikai elemzések a Filosát (Cercozoa) és az Endomyxát ismét testvércsoportoknak tekintették, bár modern rendszerek szerint az Endomyxa, a Cercozoa és a Retaria a Rhizaria önálló törzsei.

Belső

A Cercozoa korábban a Filosát és az Endomyxát is tartalmazta, de 2018-tól az Endomyxa a Cercozoán kívül van, így utóbbi a Filosa szinonimája. 2 altörzsből áll, ezek a Monadofilosa és a Reticulofilosa. Többgénes filogenetikai elemzések szerint előbbi erős klád, ahol a legkorábbi csoport a Metromonadea, a Helkesea a második (együtt alkotva a parafiletikus Eoglissát) a Ventrifilosa (Imbricatea, Sarcomonadea és Thecofilosea) leválása előtt. Azonban a Reticulofilosa valószínűleg parafiletikus, a Granofilosea a Chlorarachnea előtt vált le, így ez utóbbi a Monadofilosa testvércsoportja.

Cercozoa

Monadofilosa

Ventrifilosa

Imbricatea

Sarcomonadea

Thecofilosea

Helkesea

Metromonadea

Chlorarachnea

Granofilosea



Egy 2019-es filogenomikai elemzés szerint a Monadofilosa és a Reticulofilosa monofiletikusak a Cercozoán belül.

A Granofilosea, a Chloraracnea és a Monadofilosa mellett számos kládot fedeztek fel más elemzésekben a Cercozoán belül, például a Tremulidát és az Aquavolonidát, de helyük a Cercozoa két fő altörzse közt nem ismert. E két rend a Reticulofilosa altörzs Skiomonadea osztályába tartozik.

Rendszerezés

A Cercozoa rendszerezése 2018-ban módosult:

Jegyzetek

  1. ↑ Cavalier-Smith, T. (1998). "A revised six-kingdom system of life". Biological Reviews of the Cambridge Philosophical Society. 73 (3): 203–266. doi:10.1111/j.1469-185X.1998.tb00030.x. PMID 9809012. S2CID 6557779.
  2. ↑ Cavalier-Smith T (1997). "Amoeboflagellates and mitochondrial cristae in eukaryote evolution: megasystematics of the new protozoan subkingdoms eozoa and neozoa". Archiv für Protistenkunde. 147 (3–4): 237–258. doi:10.1016/S0003-9365(97)80051-6. ISSN 0003-9365.
  3. 1 2 3 4 5 6 7 Cavalier-Smith, Thomas; E. Chao, Ema; Lewis, Rhodri (2018). "Multigene phylogeny and cell evolution of chromist infrakingdom Rhizaria: contrasting cell organisation of sister phyla Cercozoa and Retaria". Protoplasma. 255 (5): 1517–1574. doi:10.1007/s00709-018-1241-1. PMC 6133090. PMID 29666938.
  4. ↑ Nikolaev SI, Berney C, Fahrni JF; et al. (2004. május). "The twilight of Heliozoa and rise of Rhizaria, an emerging supergroup of amoeboid eukaryotes". Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A. 101 (21): 8066–8071. doi:10.1073/pnas.0308602101. PMC 419558. PMID 15148395.{{cite journal}}: CS1 karbantartás: több név: szerzőfelsorolás (link)
  5. ↑ Hoppenrath, M.; Leander B.S. (2006). "Ebriid phylogeny and the expansion of the Cercozoa". Protist. 157 (3): 279–90. doi:10.1016/j.protis.2006.03.002. PMID 16730229.
  6. ↑ Chantangsi C (2009). Comparative morphology and molecular evolution of marine interstitial cercozoans (PhD thesis). University of British Columbia.
  7. ↑ "Systematic biology: Cercozoa". 2015. április 2. dátummal az eredeti címről archiválva. Hozzáférés: 2009. március 28.
  8. 1 2 Bass D, Cavalier-Smith T (2004. november 1.). "Phylum-specific environmental DNA analysis reveals remarkably high global biodiversity of Cercozoa (Protozoa)". International Journal of Systematic and Evolutionary Microbiology. 54 (6): 2393–2404. doi:10.1099/ijs.0.63229-0. PMID 15545489.
  9. ↑ Cavalier-Smith T, Chao EE (2003. október). "Phylogeny and classification of phylum Cercozoa (Protozoa)" (PDF). Protist. 154 (3–4): 341–358. doi:10.1078/143446103322454112. PMID 14658494.
  10. 1 2 3 Bass D, Chao EE, Nikolaev S; et al. (2009. február). "Phylogeny of Novel Naked Filose and Reticulose Cercozoa: Granofilosea cl. n. and Proteomyxidea Revised". Protist. 160 (1): 75–109. doi:10.1016/j.protis.2008.07.002. PMID 18952499.{{cite journal}}: CS1 karbantartás: több név: szerzőfelsorolás (link)
  11. ↑ Nakamura, Yasuhide; Imai, Ichiro; Yamaguchi, Atsushi; Tuji, Akihiro; Not, Fabrice; Suzuki, Noritoshi (2015). "Molecular Phylogeny of the Widely Distributed Marine Protists, Phaeodaria (Rhizaria, Cercozoa)". Protist. 166 (3): 363–373. doi:10.1016/j.protis.2015.05.004. PMID 26083083.
  12. 1 2 Harder C, Rønn R, Brejnrod A; et al. (2016. március 8.). "Local diversity of heathland Cercozoa explored by in-depth sequencing". The ISME Journal. 10 (10): 2488–2497. doi:10.1038/ismej.2016.31. PMC 5030685. PMID 26953604. {{cite journal}}: Explicit use of et al. in: |author= (súgó)CS1 karbantartás: több név: szerzőfelsorolás (link)
  13. ↑ Bass D, Silberman JD, Brown MW, Pearce RA, Tice AK, Jousset A, Geisen S, Hartikainen H (2016. február 23.). "Coprophilic amoebae and flagellates, including Guttulinopsis, Rosculus and Helkesimastix, characterise a divergent and diverse rhizarian radiation and contribute to a large diversity of faecal-associated protists". Environmental Microbiology. 18 (5): 1604–1619. doi:10.1111/1462-2920.13235. PMID 26914587.{{cite journal}}: CS1 karbantartás: több név: szerzőfelsorolás (link)
  14. ↑ Flues S, Bass D, Bonkowski M (2017. június 15.). "Grazing of leaf-associated Cercomonads (Protists: Rhizaria: Cercozoa) structures bacterial community composition and function". Environmental Microbiology. 19 (8): 3297–3309. doi:10.1111/1462-2920.13824. PMID 28618206.{{cite journal}}: CS1 karbantartás: több név: szerzőfelsorolás (link)
  15. 1 2 3 Irwin, Nicholas A.T.; Tikhonenkov, Denis V.; Hehenberger, Elisabeth; Mylnikov, Alexander P.; Burki, Fabien; Keeling, Patrick J. (2019. január 1.). "Phylogenomics supports the monophyly of the Cercozoa". Molecular Phylogenetics and Evolution (angol nyelven). 130: 416–423. doi:10.1016/j.ympev.2018.09.004. ISSN 1055-7903. PMID 30318266. S2CID 52982396.
  16. 1 2 Howe, Alexis T.; Bass, David; Scoble, Josephine M.; Lewis, Rhodri; Vickerman, Keith; Arndt, Hartmut; Cavalier-Smith, Thomas (2011). "Novel Cultured Protists Identify Deep-branching Environmental DNA Clades of Cercozoa: New Genera Tremula, Micrometopion, Minimassisteria, Nudifila, Peregrinia". Protist. 162 (2): 332–372. doi:10.1016/j.protis.2010.10.002. ISSN 1434-4610. PMID 21295519.
  17. ↑ Burki F, Corradi N, Sierra R, Meyer GR, Abbott CL, Keeling PJ; et al. (2013. július). "Phylogenomics of the Intracellular Parasite Mikrocytos mackini Reveals Evidence for a Mitosome in Rhizaria". Current Biology. 23 (16): 1541–1547. doi:10.1016/j.cub.2013.06.033. PMID 23891116. S2CID 8257631. {{cite journal}}: Explicit use of et al. in: |author= (súgó)CS1 karbantartás: több név: szerzőfelsorolás (link)
  18. ↑ Burki F, Kudryavtsev A, Matz MV; et al. (2010). "Evolution of Rhizaria: new insights from phylogenomic analysis of uncultivated protists". BMC Evol Biol. 10: 377. doi:10.1186/1471-2148-10-377. PMC 3014934. PMID 21126361. {{cite journal}}: Explicit use of et al. in: |author= (súgó)CS1 karbantartás: jelöletlen szabad DOI (link) CS1 karbantartás: több név: szerzőfelsorolás (link)
  19. ↑ Krabberød, Anders K.; Orr, Russell J.S.; Bråte, Jon; Kristensen, Tom; Bjørklund, Kjell R.; Shalchian-Tabrizi, Kamran (2017). "Single Cell Transcriptomics, Mega-Phylogeny, and the Genetic Basis of Morphological Innovations in Rhizaria". Mol. Biol. Evol. 34 (7): 1557–1573. doi:10.1093/molbev/msx075. PMC 5455982. PMID 28333264.
  20. ↑ Adl SM, Bass D, Lane CE, Lukeš J, Schoch CL, Smirnov A, Agatha S, Berney C, Brown MW, Burki F, Cárdenas P, Čepička I, Chistyakova L, del Campo J, Dunthorn M, Edvardsen B, Eglit Y, Guillou L, Hampl V, Heiss AA, Hoppenrath M, James TY, Karnkowska A, Karpov S, Kim E, Kolisko M, Kudryavtsev A, Lahr DJG, Lara E, Le Gall L, Lynn DH, Mann DG, Massana R, Mitchell EAD, Morrow C, Park JS, Pawlowski JW, Powell MJ, Richter DJ, Rueckert S, Shadwick L, Shimano S, Spiegel FW, Torruella G, Youssef N, Zlatogursky V, Zhang Q (2019). "Revisions to the Classification, Nomenclature, and Diversity of Eukaryotes". Journal of Eukaryotic Microbiology. 66 (1): 4–119. doi:10.1111/jeu.12691. PMC 6492006. PMID 30257078.{{cite journal}}: CS1 karbantartás: több név: szerzőfelsorolás (link)
  21. ↑ Bass D, Tikhonenkov DV, Foster R, Dyal P, Janouškovec J, Keeling PJ, Gardner M, Neuhauser S, Hartikainen H, Mylnikov AP, Berney C (2018). "Rhizarian 'Novel Clade 10' Revealed as Abundant and Diverse Planktonic and Terrestrial Flagellates, including Aquavolon n. gen". Journal of Eukaryotic Microbiology. 65 (6): 828–842. doi:10.1111/jeu.12524. PMC 6282753. PMID 29658156.{{cite journal}}: CS1 karbantartás: több név: szerzőfelsorolás (link)

Fordítás

Ez a szócikk részben vagy egészben a Cercozoa című angol Wikipédia-szócikk ezen változatának fordításán alapul. Az eredeti cikk szerkesztőit annak laptörténete sorolja fel. Ez a jelzés csupán a megfogalmazás eredetét és a szerzői jogokat jelzi, nem szolgál a cikkben szereplő információk forrásmegjelöléseként.

További információk