Ichthyophonida
Az Ichthyophonida az Ichthyosporea állatparazita, kommenzalista és szabadon élő fajokból álló rendje. A Caullery mesnili a Daphnia nem fajainak genetikai szerkezetét befolyásolhatja, szaporodóképességét 95%-kal csökkentheti.
Parazita fajai elsősorban halak, rovarok és kétéltűek patogénjei, a halfertőzések általában szubklinikaiak, jelentkezhetnek tengeri, anadrom vagy néhány édesvízi halban is.
Morfológia
Testvércsoportjával, a Dermocystidával szemben zoospórái nem rendelkeznek ostorral, de a Sphaeroforma sirkka és a Sphaeroforma napiecek esetén rövid ostorszerű szálakkal rendelkező vezikulumokat észleltek elektronmikroszkóppal. Életciklusuk során kolóniát képeznek szincítiumuk sejtekké osztódásával egyes nyálkagombákhoz és gombákhoz hasonlóan.
A gombákhoz hasonlóan nem rendelkeznek kinetidákkal .
Életmód
Legtöbb tagjuk állatparazita, de számos kommenzalista vagy szabadon élő fajuk is ismert.
Taxonómia
Tagjai többek közt:
Subordo Sphaeroformina Cavalier-Smith 2012
Familia Creolimacidae Cavalier-Smith 2012
Familia Psorospermidae Cavalier-Smith 2012
Familia Piridae Cavalier-Smith 2012
Subordo Trichomycina Cavalier-Smith 2012
†Paleocadus Poinar 2016
Familia Amoebidiidae Lichtenstein 1917 ex Kirk et al. 2001
Familia Ichthyophonidae Cavalier-Smith 2012
Familia Paramoebidiidae Reynolds et al. 2017
Familia Parataeniellaceae Manier et Lichtward 1968
Familia Eccrinaceae Leger et Duboscq 1929 [Palavasciaceae Manier et Lichtward 1968]
Genomika
Az Ichthyophonida a tengeri Opisthokonta-tagok legkisebb (nano-, piko-) csoportjaiban gyakoribb, mint a többi csoportban – a pikocsoportban a leggyakoribb (mintegy 60%) –, míg testvércsoportja, a Dermocystida a nano- és a mezocsoportban közel azonos
Az S -adenozilmetionin-dekarboxilázban a 31. helyen 1 kivétellel minden fajban prolin van.
Először az Ichthyophonidában, majd annak egyes fajaiban is bekövetkezett szekunder genombővülés, és kevesebb intront vesztettek, mint a Chromosphaera vagy a Corallochytrium esetén.:5. ábra A magas intronsűrűség hozzájárulhatott a transzkriptomváltozás magas szintjéhez.
A nonszenszmediált bontás fehérjekomplexe alapvető génjei – az UPF1 –3 , az SMG1 , az SMG5 –9 , az 1-es és 3-as felszabadítási faktor és az exon-kapcsolat komplex – az Ichthyophonida utolsó közös ősében állandósult, akárcsak az állatok vagy a Choanozoa közös ősében.
Jegyzetek
↑ Wolinska J, Petrusek A, Yin M, Koerner H, Seda J, Giessler S (2014. december 4.). "Population structure of a microparasite infecting Daphnia: spatio-temporal dynamics" . BMC Evol Biol . 14 : 247. doi :10.1186/s12862-014-0247-3 . PMC 4265321 . PMID 25471262 . {{cite journal }}: CS1 karbantartás: jelöletlen szabad DOI (link ) CS1 karbantartás: több név: szerzőfelsorolás (link )
↑ Berrocal A, López A (2007). "Nasal rhinosporidiosis in a mule" . Can Vet J . 48 (3): 305– 306. PMC 1800950 . PMID 17436910 .
↑ Mocho JP, Collymore C, Farmer SC, Leguay E, Murray KN, Pereira N (2022. június 1.). "FELASA-AALAS Recommendations for Monitoring and Reporting of Laboratory Fish Diseases and Health Status, with an Emphasis on Zebrafish (Danio rerio)" . Comp Med . 72 (3): 127– 148. doi :10.30802/AALAS-CM-22-000034 . PMC 9334007 . PMID 35513000 . {{cite journal }}: CS1 karbantartás: több név: szerzőfelsorolás (link )
↑ Tikhonenkov DV, Hehenberger E, Esaulov AS, Belyakova OI, Mazei YA, Mylnikov AP, Keeling PJ (2020. április 9.). "Insights into the origin of metazoan multicellularity from predatory unicellular relatives of animals" . BMC Biol . 18 (1): 39. doi :10.1186/s12915-020-0762-1 . PMC 7147346 . PMID 32272915 . {{cite journal }}: CS1 karbantartás: jelöletlen szabad DOI (link ) CS1 karbantartás: több név: szerzőfelsorolás (link )
↑ Suga H, Ruiz-Trillo I (2013. május 1.). "Development of ichthyosporeans sheds light on the origin of metazoan multicellularity" . Dev Biol . 377 (1): 284– 92. doi :10.1016/j.ydbio.2013.01.009 . PMC 4342548 . PMID 23333946 .
↑ Paps J, Medina-Chacón LA, Marshall W, Suga H, Ruiz-Trillo I (2013). "Molecular phylogeny of unikonts: new insights into the position of apusomonads and ancyromonads and the internal relationships of opisthokonts" . Protist . 164 (1): 2– 12. doi :10.1016/j.protis.2012.09.002 . PMC 4342546 . PMID 23083534 . CS1 karbantartás: több név: szerzőfelsorolás (link )
↑ Cury JC, Araujo FV, Coelho-Souza SA, Peixoto RS, Oliveira JA, Santos HF, Dávila AM, Rosado AS (2011. január 27.). "Microbial diversity of a Brazilian coastal region influenced by an upwelling system and anthropogenic activity" . PLoS One . 6 (1): e16553. doi :10.1371/journal.pone.0016553 . PMC 3029357 . PMID 21304582 . {{cite journal }}: CS1 karbantartás: jelöletlen szabad DOI (link ) CS1 karbantartás: oldalszám helyett cikk száma (link ) CS1 karbantartás: több név: szerzőfelsorolás (link )
↑ Grau-Bové X, Torruella G, Donachie S, Suga H, Leonard G, Richards TA, Ruiz-Trillo I (2017. július 20.). "Dynamics of genomic innovation in the unicellular ancestry of animals" . eLife . 6 : e26036. doi :10.7554/eLife.26036 . PMC 5560861 . PMID 28726632 . {{cite journal }}: CS1 karbantartás: jelöletlen szabad DOI (link ) CS1 karbantartás: oldalszám helyett cikk száma (link ) CS1 karbantartás: több név: szerzőfelsorolás (link )
↑ Reynolds, Nicole K.; Smith, Matthew E.; Tretter, Eric D.; Gause, Justin; Heeney, Dustin; Cafaro, Matías J.; Smith, James F.; Novak, Stephen J.; Bourland, William A.; White, Merlin M. (2017). "Resolving relationships at the animal-fungal divergence: A molecular phylogenetic study of the protist trichomycetes (Ichthyosporea, Eccrinida)" . Molecular Phylogenetics and Evolution . 109 : 447– 464. doi :10.1016/j.ympev.2017.02.007 . PMID 28219758 .
↑ "Ichthyophonida" . NCBI taxonomy (angol nyelven). Bethesda, MD: National Center for Biotechnology Information. Hozzáférés: 2018. július 31 .
↑ Arroyo AS, Iannes R, Bapteste E, Ruiz-Trillo I (2020. szeptember 1.). "Gene Similarity Networks Unveil a Potential Novel Unicellular Group Closely Related to Animals from the Tara Oceans Expedition" . Genome Biol Evol . 12 (9): 1664– 1678. doi :10.1093/gbe/evaa117 . PMC 7533066 . PMID 32533833 . {{cite journal }}: CS1 karbantartás: több név: szerzőfelsorolás (link )
↑ Volkov OA, Kinch L, Ariagno C, Deng X, Zhong S, Grishin N, Tomchick DR, Chen Z, Phillips MA (2016. december 15.). Kuriyan J (ed.). "Relief of autoinhibition by conformational switch explains enzyme activation by a catalytically dead paralog" . eLife . 5 : e20198. doi :10.7554/eLife.20198 . PMC 5201418 . PMID 27977001 . {{cite journal }}: CS1 karbantartás: jelöletlen szabad DOI (link ) CS1 karbantartás: oldalszám helyett cikk száma (link ) CS1 karbantartás: több név: szerzőfelsorolás (link )
1 2 3 Grau-Bové X, Torruella G, Donachie S, Suga H, Leonard G, Richards TA, Ruiz-Trillo I (2017. július 20.). "Dynamics of genomic innovation in the unicellular ancestry of animals" . eLife . 6 : e26036. doi :10.7554/eLife.26036 . PMC 5560861 . PMID 28726632 . {{cite journal }}: CS1 karbantartás: jelöletlen szabad DOI (link ) CS1 karbantartás: oldalszám helyett cikk száma (link ) CS1 karbantartás: több név: szerzőfelsorolás (link )
↑ Grau-Bové X, Torruella G, Donachie S, Suga H, Leonard G, Richards TA, Ruiz-Trillo I (2017. július 20.). "Dynamics of genomic innovation in the unicellular ancestry of animals" . eLife . 6 : e26036. doi :10.7554/eLife.26036 . PMC 5560861 . PMID 28726632 . {{cite journal }}: CS1 karbantartás: jelöletlen szabad DOI (link ) CS1 karbantartás: oldalszám helyett cikk száma (link ) CS1 karbantartás: több név: szerzőfelsorolás (link )