Precariedade local
Apesar da relativa melhoria urbana, na época as condições do local eram precárias: não havia infraestrutura, existia apenas 30 casas de madeira no local com aproximadamente 200 habitantes e muito a ser desbravado. A energia elétrica era racionada, gerada através de um motor estacionário que funcionava das 18 às 22 horas.
Um pequeno cômodo de madeira era usado como capela e as celebrações eram realizadas anualmente pelo sacerdote de Rio Brilhante, que se deslocava a cavalo até a vila. Foi frei João Damasceno que rezou a primeira missa nesta capelinha de madeira entre os coqueiros da praça central (denominada Jan Antonín Bata), em 29 de junho de 1948. Em 1 de maio de 1954, o capuchinho gaúcho frei Luís Maria de Tomás Flores entrou em Bataguassu como primeiro vigário da paróquia. Já nesta época, a festa religiosa em homenagem ao santo padroeiro, São João Batista, era realizada com quermesses durante o mês de junho, e a renda arrecadada era revertida para a construção da primeira igreja de alvenaria.
A alfabetização das crianças era realizada em um salão de madeira de forma bastante precária, onde um professor dava aulas por conta da companhia colonizadora. Só em 1953 foi edificado pela companhia colonizadora o primeiro prédio para realizar a alfabetização das crianças do município, com uma sala de aula, dois sanitários e alojamento para o professor Peri Barbosa Martins. Enio Martins, o tenente Nelson e amigos, preocupados com o desenvolvimento do local, conseguiram que o prédio fosse cedido para o estado de Mato Grosso. No local foi então criada a Escola Rural Mista Coronel Pedro Celestino, que teve como primeira professora Maria da Conceição, exercendo o cargo até 1965. Mais tarde, após a emancipação do município, a escola rural foi renomeada como Escolas Reunidas Manuel da Costa Lima.
Progresso e instalação
Como importantes figuras dessa história, a família Martins foi de grande significado para a história de Bataguassu. Enio Martins era descendente da família dos "Barbosa da Vacaria" e se destacava na política local. Em 1926, a família mudou-se para uma fazenda onde hoje está a cidade de Nova Andradina. A família Martins permaneceu no local até a venda da Fazenda Baile, em 1952, quando, no dia 8 de março do mesmo ano, a convite do tenente Nelson Verlangieri D'Oliveira (genro de Jan Antonin Bata), chegou em Bataguassu.
Em 1953, o governador do estado de Mato Grosso, Fernando Correia da Costa, a convite do tenente Nelson Verlangieri de Oliveira, Pery Martins e Enio Martins, visitou Bataguassu, quando inaugurou uma nova escola, a Escola Rural Mista Coronel Pedro Celestino, e assistiu a um desfile de máquinas agrícolas. Empolgado, o governador prometeu a emancipação política de Bataguassu. No dia 11 de dezembro do mesmo ano, assinou a Lei nº 683, que elevou a vila a sede de município, o qual tinha as mesmas divisas do distrito de Ivinhema, abrangendo as terras que hoje formam os municípios de Bataguassu, Anaurilândia, Nova Andradina, Bataiporã e Taquarussu. A partir desta data foi nomeado prefeito de Bataguassu Ladislau Deák Filho.
Segundo a formação administrativa registrada pelo IBGE, o município foi criado com a denominação de Bataguassu pela lei estadual nº 683, de 11 de dezembro de 1953, desmembrado de Rio Brilhante, constituído de dois distritos: Bataguassu e Ivinhema. Pela lei estadual nº 669, da mesma data, foi criado o distrito de Bataiporã, anexado ao município, e pela lei nº 672, também de 11 de dezembro de 1953, foi criado o distrito de Anaurilândia. Em 1958, o distrito de Ivinhema foi extinto e seu território anexado ao distrito-sede do município de Nova Andradina.
Apesar de Bataguassu ter sido criada em 1953, a ata da sessão especial de instalação do município e da administração municipal, bem como de compromisso e posse dos vereadores e de instalação da Câmara Municipal e do primeiro prefeito eleito, é de 19 de fevereiro de 1955, tendo como primeiro prefeito eleito o sr. Enio Martins e seu vice-prefeito o sr. Domício de Aragão Bulcão, que exerceu o cargo posteriormente por mais dois mandatos. Os primeiros vereadores eleitos foram Pery Barbosa Martins, Lázaro Severino da Silva, José Heitor de Almeida Camargo, Laucidio Ávila de Lima e Joaquim Silvério da Silva.
Após a posse concedida pelo juiz eleitoral da 11ª zona eleitoral, dr. Silvio Borba Carrilho de Oliveira, foi feita a eleição para composição da Mesa Diretora da Câmara Municipal, sendo eleito o primeiro presidente da Câmara Municipal o senhor Pery Barbosa Martins, vice-presidente o sr. José Heitor de Almeida Camargo e 1º secretário o sr. Lázaro Severino da Silva.
A terra foi recebendo novos habitantes que mais tarde influenciariam em seus destinos, tais como José Vicente Vitiritti, José Veríssimo do Amaral, Ailton Pinheiro Ferreira, Shiguetsugo Kawanami, Yataka Kasai, Francisco Machado de Sousa, Adonel Elias Barbosa, Arlindo Evaristo Bonfim, Odorilho Ferreira, José Francisco Xavier, Manuel Pereira de Sousa, José Alves Barroso, Vladimir Kubik e Anésio Alves da Silva.
Pioneiro e colonizador do município, Vladimir Kubik atuou ao lado de Jan Antonín Bata na colonização de parte da região sudeste de Mato Grosso do Sul, que só foi possível graças à Companhia Viação São Paulo-Mato Grosso, da qual Antonin Bata era o proprietário e Kubik trabalhava como administrador. Junto com seu filho, Vladmir José Kubik, lançou um dos primeiros loteamentos imobiliários de Bataguassu.
Pela lei estadual nº 1.948, de 11 de novembro de 1963, o distrito de Anaurilândia foi desmembrado de Bataguassu e elevado à categoria de município; pela lei estadual nº 1.967, de 12 de novembro de 1963, o mesmo ocorreu com o distrito de Bataiporã. Ainda em 1963, pela lei estadual nº 1.109, de 26 de dezembro, foi criado o distrito de Porto XV de Novembro, anexado ao município. Em divisão territorial datada de 1979, o município era constituído de dois distritos: Bataguassu e Porto XV de Novembro.
Em 1977, o município passou a fazer parte do atual estado de Mato Grosso do Sul, criado pela lei complementar federal nº 31, de 11 de outubro daquele ano.
