Neokaryota

Neokaryota
Rendszertani besorolás
Domén: Eukarióták (Eukaryota)
Csoport: Orthokaryota
Csoport: Neokaryota
Csoportok

A Neokaryota (Cavalier-Smith 1993) eukarióták javasolt kládja, a Jakobida testvérkládja, tagjai az Opimoda és a Diphoda. E nézet szerint az Euglenozoa, a Tsukubea és a Jakobida bazálisabb eukariótáknak tekintettek. E 4 csoport hagyományosan a Discoba tagja, azonban ez lehet parafiletikus csoport, mivel a Neokaryota itt jelent meg.

Al Jewari és Baldauf 2023-as analízise szerint monofiletikus csoport.

Taxonómia

Egy javasolt kladogram:

Eukaryota

Tsukubea
Discicristata

Euglenozoa

Percolozoa



Orthokaryota

Jakobea


Neokaryota
Corticata/Diaphoretickes

Archaeplastida


Chromista

Hacrobia

Sar




Scotokaryota

Metamonada

Malawimonas


Sulcozoa/Podiata

CRuMs


Amorphea

Amoebozoa


Obazoa

Breviata

Apusomonadida

Opisthokonta












Hipotézisek

Eozoa

A mitokondriumok (anaerob fajokban mitoszómák) TOM40-en alapuló jelenléte alapján nem valószínűsíthető, hogy élnek még premitokondriális eukarióták, mivel minden ismert élő taxon rendelkezik mitokondriumokkal vagy azok maradványaival – tehát az eukarióták közös őse nem lehetett a többek közt a Giardia és Trichomonas génuszokat tartalmazó szekunder anaerob Metamonada tagja, hanem primer aerob törzsben életett. A szekunder anaerob fajok mitoszómái nem önállóan fejlődtek α-proteobaktériumokból, ezt igazolja a Neokaryotában a TOM40 jelenléte. Az ostoros moszatok két fő jellemzője a TOM40 hiánya mellett az origófelismerő komplex (ORC) hiánya, melyek feltehetően ősiek.

Feltehetően a Neokaryota közös, de nem az összes eukariótára jellemző fehérjéje továbbá az RNS-polimeráz II IIA, F és H transzkripciós faktora, mely a Trypanosomatida esetén hiányzik, amennyiben azt nem akkor vesztették el az ostoros moszatok, amikor utolsó közös ősük a Neomura eredeti transzkripciós szabályzását poszttranszkripciósra cserélték. Az eukarióták utolsó közös őse Cavalier-Smith 2010-es tanulmánya szerint ivaros szaporodásra képes, maggal rendelkező fagotróf protozoon volt legalább 1 centriólummal, ostorral, fakultatív aerob mitokondriummal. Valószínűleg nem volt fotoszintetikus, hacsak a cianobaktériumok kloroplasztiszokká alakulása a mitokondrium megjelenésével közel egyidejű, azonban ez, ha az Excavatán vagy az Euglenozoán belül van az ős, valószínűtlen. Fagocitózishoz sejtszája és sejtgaratja lehetett elöl, ha egyostorú volt, 2, ha kétostorú, 3 mikrotubulussáva volt.:2. ábra

Cavalier-Smith egyik 2018-as tanulmányában az Excavata országot informálisként – szervezettségi szintként, nem kládként – írta le, és oda csak a Loukozoa és Jakobea csoportokat sorolta, a Neokaryotába 3 csoportot (Scotokaryota, Neozoa, Corticata) helyezett.

Hosszú mitokondriális genomok

Az Ancoracysta twista mitokondriumában 47 α-proteobaktérium-gént találtak Janouškovec et al. 2017-es tanulmányukban, míg Kamikawa et al. 2016-os tanulmányukban a Diphylleia rotanséban 51-et írtak le, és a Neokaryota közös ősének genomja legalább 55 mitokondriális fehérjekódoló gént tartalmazhatott. Az Eozoába sorolt Jakobida 65 ilyen gént tartalmaz, és benne fennmaradtak a bakteriális 4 fehérjés RNS-polimerázok és a SecY. Ezenkívül az Eozoa az egyetlen szupercsoport egymolekulás citokróm c-hem-liáz (holocitokróm c-szintáz) nélkül.

Discoba

Egy kiadás előtt álló tanulmány szerint a főemlősök α-szatellit-DNS-ei az Eutheria közös őséig vezethetők vissza, de már a Neokaryota utolsó közös ősében is jelen voltak α-satDNS-ek.:16 A Discoba vizsgált fajaiban csak α-satDNS-t találtak.:4–5 A tanulmány szerint a α- és β-satDNS a Neokaryotában jelenhetett meg, miután ősük elkülönült a Discobáétól.:7

Jegyzetek

  1. ↑ Cavalier-Smith, Thomas (2013. május 1.). "Early evolution of eukaryote feeding modes, cell structural diversity, and classification of the protozoan phyla Loukozoa, Sulcozoa, and Choanozoa". European Journal of Protistology. 49 (2): 115–178. doi:10.1016/j.ejop.2012.06.001. PMID 23085100.
  2. ↑ Al Jewari, Caesar; Baldauf, Sandra L. (2023. április 28.). "An excavate root for the eukaryote tree of life". Science Advances. 9 (17): eade4973. Bibcode:2023SciA....9E4973A. doi:10.1126/sciadv.ade4973. ISSN 2375-2548. PMC 10146883. PMID 37115919.{{cite journal}}: CS1 karbantartás: oldalszám helyett cikk száma (link)
  3. ↑ Derelle, Romain; Torruella, Guifré; Klimeš, Vladimír; Brinkmann, Henner; Kim, Eunsoo; Vlček, Čestmír; Lang, B. Franz; Eliáš, Marek (2015. február 17.). "Bacterial proteins pinpoint a single eukaryotic root". Proceedings of the National Academy of Sciences (angol nyelven). 112 (7): E693–E699. Bibcode:2015PNAS..112E.693D. doi:10.1073/pnas.1420657112. ISSN 0027-8424. PMC 4343179. PMID 25646484.
  4. ↑ Cavalier-Smith, T.; Chao, E. E.; Snell, E. A.; Berney, C.; Fiore-Donno, A. M.; Lewis, R. (2014). "Multigene eukaryote phylogeny reveals the likely protozoan ancestors of opisthokonts (animals, fungi, choanozoans) and Amoebozoa". Molecular Phylogenetics & Evolution. 81: 71–85. doi:10.1016/j.ympev.2014.08.012. PMID 25152275.
  5. 1 2 3 4 5 6 Cavalier-Smith, Thomas (2010. június 23.). "Kingdoms Protozoa and Chromista and the eozoan root of the eukaryotic tree". Biology Letters (angol nyelven). 6 (3): 342–345. doi:10.1098/rsbl.2009.0948. ISSN 1744-9561. PMC 2880060. PMID 20031978.
  6. ↑ He, Ding; Fiz-Palacios, Omar; Fu, Cheng-Jie; Fehling, Johanna; Tsai, Chun-Chieh; Baldauf, Sandra L. (2014). "An Alternative Root for the Eukaryote Tree of Life". Current Biology. 24 (4): 465–470. doi:10.1016/j.cub.2014.01.036. PMID 24508168.
  7. ↑ Cavelier Smith (2013). "Early evolution of eukaryote feeding modes, cell structural diversity, and classification of the protozoan phyla Loukozoa, Sulcozoa, and Choanozoa". European Journal of Protistology. 49 (2): 115–178. doi:10.1016/j.ejop.2012.06.001. PMID 23085100.
  8. ↑ Hug, Laura A.; Baker, Brett J.; Anantharaman, Karthik; Brown, Christopher T.; Probst, Alexander J.; Castelle, Cindy J.; Butterfield, Cristina N.; Hernsdorf, Alex W.; Amano, Yuki (2016. április 11.). "A new view of the tree of life". Nature Microbiology (angol nyelven). 1 (5): 16048. doi:10.1038/nmicrobiol.2016.48. ISSN 2058-5276. PMID 27572647.
  9. ↑ Cavalier-Smith, Thomas; Chao, Ema E.; Lewis, Rhodri (2016. június 1.). "187-gene phylogeny of protozoan phylum Amoebozoa reveals a new class (Cutosea) of deep-branching, ultrastructurally unique, enveloped marine Lobosa and clarifies amoeba evolution". Molecular Phylogenetics and Evolution. 99: 275–296. doi:10.1016/j.ympev.2016.03.023. PMID 27001604.
  10. ↑ Cavalier-Smith, Thomas (2017. szeptember 5.). "Kingdom Chromista and its eight phyla: a new synthesis emphasising periplastid protein targeting, cytoskeletal and periplastid evolution, and ancient divergences". Protoplasma (angol nyelven). 255 (1): 297–357. doi:10.1007/s00709-017-1147-3. ISSN 0033-183X. PMC 5756292. PMID 28875267.
  11. 1 2 Cavalier-Smith, Thomas; Chao, Ema E.; Lewis, Rhodri (2018. április). "Multigene phylogeny and cell evolution of chromist infrakingdom Rhizaria: contrasting cell organisation of sister phyla Cercozoa and Retaria". Protoplasma. 255 (5): 1517–1574. doi:10.1007/s00709-018-1241-1. PMC 6133090. PMID 29666938.
  12. 1 2 3 Wang J, Zhu X, Yang J, Zhang L, Gao Z-h, Li J, Guo Y (2024. május 1.). "Alpha Satellite DNAs in Eukaryotes: Widespread Distribution and Horizontal Transfers". Hozzáférés: 2024. június 22. {{cite journal}}: Cite journal requires |journal= (súgó)CS1 karbantartás: több név: szerzőfelsorolás (link)

Fordítás

Ez a szócikk részben vagy egészben a Neokaryotes című angol Wikipédia-szócikk ezen változatának fordításán alapul. Az eredeti cikk szerkesztőit annak laptörténete sorolja fel. Ez a jelzés csupán a megfogalmazás eredetét és a szerzői jogokat jelzi, nem szolgál a cikkben szereplő információk forrásmegjelöléseként.

További információk